Nachteile:

großes Problem durch störende Interferenzen
Für holographische Abbildungen sind sehr teure, hoch präzise optische Linsen und Systeme erforderlich, jedoch schafft man hier Abhilfe durch Verwenden der selben Linse zum Lesen, wie zum Schreiben. Aber, um die Linse auch zum Lesen verwenden zu können, muss man einen Trick anwenden: Man muss die Rückwertsprojektion verwenden
Die Speichermedien "Schrumpfen" beim Beschreiben (vorallem Polymerfilme)
das Auslesen kann die Informationen zerstören
Die Medien müssen vor dem Beschreiben lichdicht verpackt sein, da das Licht die Eigenschaften des Materials verändern kann